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PathIN ist ein Web-Service, der eine einfache und flexible Möglichkeit bietet, um schnell netzwerkbasierte Signalwege auf mehreren funktionalen biologischen Ebenen zu erstellen: Gene, Verbindungen und Reaktionen. Das Tool wird von einem Datenbank-Repository von Referenz-Signalwegnetzwerken über eine große Anzahl von Arten unterstützt, das durch die frei verfügbaren Informationen aus den KEGG-, Reactome- und Wiki Pathways-Datenbank-Repositorys entwickelt wurde. PathIN bietet Netzwerke durch fünf unterschiedliche Methoden an: (a) direkte Verbindungen zwischen interessierenden Signalwegen, (b) direkte Verbindungen sowie die ersten Nachbarn der gegebenen Signalwege, (c) direkte Verbindungen, die ersten Nachbarn und die Verbindungen zwischen ihnen, und (d) zwei zusätzliche Methoden zur Erstellung komplementärer Signalweg-zu-Signalweg-Netzwerke, die zusätzliche (fehlende) Signalwege einbeziehen, die zwischen den interessierenden Signalwegen interferieren. Es wird erwartet, dass PathIN als einfaches, aber informatives Referenzwerkzeug zur Verständnis von Netzwerken molekularer Mechanismen im Zusammenhang mit spezifischen Krankheiten verwendet wird.
Minadakis et al. (Sun,) untersuchten diese Frage.