Der Terminationsfaktor Rho und seine Kofaktoren NusA und NusG unterdrücken fremde DNA in E. coli

Die Transkription des bakteriellen Genoms durch die RNA-Polymerase muss an spezifischen Punkten enden. Die Transkription kann durch den Rho-Faktor, ein essentielles Protein in Enterobakterien, beendet werden. Wir verwendeten das Antibiotikum Bicyclomycin, das Rho hemmt, um seine Rolle auf genomweiter Ebene zu bewerten. Rho wird als globaler Regulator der Genexpression offenbart, der die Transkription von Escherichia coli an die translationalen Bedürfnisse anpasst. Wir fanden auch heraus, dass Gene in E. coli, die am stärksten durch Rho repressiert werden, Prophagen und andere horizontal erworbene Teile des Genoms sind. Die Eliminierung dieser fremden DNA-Elemente erhöht die Resistenz gegen Bicyclomycin. Obwohl Rho essentiell bleibt, benötigen solche reduzierten Genom-Bakterien die Rho-Kofaktoren NusA und NusG nicht mehr. Die Löschung des kryptischen rac-Prophagen in wildtypischem E. coli erhöht die Bicyclomycin-Resistenz und ermöglicht die Löschung von nusG. Somit ist die Rho-Terminierung, unterstützt von NusA und NusG, erforderlich, um die toxische Aktivität fremder Gene zu unterdrücken.