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Wir präsentieren einen maximalen Entropieansatz zur Ableitung von Aminosäureinteraktionen in Proteinen, der den Einschränkungen hinsichtlich der mittleren Anzahl verschiedener Typen von Gleichgewichts-Kontakten für eine gegebene Sequenz oder ein Set von Sequenzen unterliegt. Wir haben mehrere Arten von Tests für ein zweidimensionales Gittermodell mit nur zwei Arten von Aminosäuren durchgeführt, mit sehr vielversprechenden Ergebnissen. Wir zeigen auch, dass die Methode sehr gut funktioniert, selbst wenn die mittleren Kontaktzahlen nicht bekannt sind und daher auf reale Proteine angewendet werden kann.
Seno et al. (Mittwoch) untersuchten diese Frage.