Bewertung der Bewertung—Alles über Komplexe

Die Vorhersage der Modellqualität ist ein grundlegender Bestandteil jedes Modellierungsverfahrens, und die blinde Bewertung dieser Methoden stellt einen entscheidenden Aspekt des Critical Assessment of Protein Structure Prediction (CASP) Experiments dar. Historisch lag der Hauptfokus auf der Bewertung von Methoden, die globale und residuen-spezifische Genauigkeiten in Modellen der tertiären Struktur vorhersagen. Dieser Fokus verschob sich mit den zunehmenden Bemühungen der Gemeinschaft in der Modellierung von Komplexen und Assemblierungen. Wir baten die Gemeinschaft, die Modelle aus der CASP15-Assemblierungskategorie zu verarbeiten und Schätzungen zur Genauigkeit der vorhergesagten quartären Struktur sowohl global als auch auf der lokalen Interface-Ebene bereitzustellen. Neben der Identifizierung bemerkenswerter Genauigkeit von Modellierungsgruppen bei der Bewertung ihrer eigenen Vorhersagen richteten wir eine Benchmarking-Pipeline ein, um verschiedene Aspekte von Modellen der quartären Struktur hervorzuheben, und führten eine einfache Konsens-EMA-Methode als Basislinie ein. Während die beteiligten Methoden eine lobenswerte Leistung zeigten, war es schwierig, die Basislinie zu übertreffen. Es ist wichtig zu betonen, dass die Vorhersageleistung für die einzelnen CASP-Ziele variiert, was potenzielle Verbesserungs- und Herausforderungen aufzeigt.