Die Mutationsraten von Di-, Tri- und Tetranukleotidwiederholungen in Drosophila melanogaster

In einer aktuellen Studie berichteten wir, dass die kombinierte durchschnittliche Mutationsrate von 10 Di-, 6 Tri- und 8 Tetranukleotidwiederholungen in Drosophila melanogaster 6,3 x 10(-6) Mutationen pro Locus pro Generation betrug, eine Rate, die deutlich unter der von bis heute untersuchten Mikrosatelliten-Wiederholungseinheiten in Säugetieren liegt (Bereich = 10(-2)-10(-5) pro Locus pro Generation). Um eine genauere Schätzung der Mutationsrate für allein stehende Dinukleotidwiederholungsmotive zu erhalten, untersuchten wir 39 neue Dinukleotidwiederholungs-Mikrosatelliten-Loci in den Mutationsakkumulationslinien unserer früheren Studie. Unsere Schätzung der Mutationsrate für insgesamt 49 Dinukleotidwiederholungen beträgt 9,3 x 10(-6) pro Locus pro Generation, was nur leicht höher ist als die Schätzung aus unserer früheren Studie. Wir schätzten auch den relativen Unterschied in der Mikrosatelliten-Mutationsrate zwischen Di-, Tri- und Tetranukleotidwiederholungen im Genom von D. melanogaster unter Verwendung einer auf der Variabilität der Population basierenden Methode und fanden heraus, dass Tri- und Tetranukleotidwiederholungen mit Raten von 6,4 und 8,4 Mal langsamer mutieren als Dinukleotidwiederholungen. Die langsameren Mutationsraten von Tri- und Tetranukleotidwiederholungen scheinen mit einer relativ kurzen Wiederholungseinheitslänge dieser Wiederholungsmotive im Genom von D. melanogaster assoziiert zu sein. Eine positive Korrelation zwischen der Länge der Wiederholungseinheit und der allelischen Variation deutet darauf hin, dass die Mutationsrate steigt, wenn die Längen der Wiederholungseinheiten von Mikrosatelliten zunehmen.