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Die Whole-Genome-Sequenzierung (WGS) hat großes Potenzial in der schnellen Diagnose der medikamentenresistenten Tuberkulose gezeigt;1,2 jedoch sind die Diskrepanzen zwischen WGS-basiertem Medikamentensensibilitäts-Test (DST) und phänotypischem DST aufgrund des Mangels an hochwertigen phänotypischen DST-Daten nicht gut charakterisiert worden. Kürzlich wurde von der WHO das größte, global beschaffte Datenset von Mycobacterium tuberculosis-Stämmen mit WGS-Daten und phänotypischen DST-Daten erstellt,3,4 das eine wertvolle und umfassende Ressource zur detaillierten Untersuchung der Diskrepanzen zwischen genotypischen und phänotypischen DST bietet.
Chen et al. (Freitag) haben diese Frage untersucht.