Die Verwendung von Long-PCR zur Bestätigung drei häufiger Allele am CYP2A6-Lokus und die Beziehung zwischen Genotyp und Rauchgewohnheit

Long-PCR gefolgt von Nested PCR wurde zuvor verwendet, um CYP2A6 160H Allele zu bestimmen, aber die Methode erwies sich als unzuverlässig. Wir haben diesen Ansatz in einer DNA-Bank von 1032 Probanden (Altersspanne 59-74 Jahre) optimiert, um zuverlässige Ergebnisse zu erzielen, die indirekte molekulare Beweise und sehr starke statistische Beweise für bisher nicht erkannte häufige Allele (bezeichnet als O) liefern, die gegen die Long-PCR resistent sind. Drei Allele (160L, 160H und O) kodierend und ein Ansatz zur Assoziationsanalyse, der ursprünglich entwickelt wurde, um mit Nullallelen umzugehen, die in der ABO-Blutgruppentypisierung enthalten sind, wurde der Beitrag von 160H (funktionell null) zur verringerten Rauchergewohnheit zum ersten Mal klar gemessen, ohne durch Allele, die für die Long-PCR null sind, verzerrt zu werden. Die signifikantesten Ergebnisse (p < 0.01) sind, dass der Besitz eines 160H-Allels im Vergleich zu keinem 160H-Allel mit einem durchschnittlichen Beginn des regelmäßigen Rauchens 3 Jahre später assoziiert ist (95% CI +/- 1.93 Jahre, durchschnittliches Beginnalter 20-21 Jahre statt 17-18 Jahre); und dass die durchschnittliche Wahrscheinlichkeit, zu irgendeinem Zeitpunkt mit dem Rauchen aufzuhören, 1,75-fach (95% CI, 1.17-2.61) für diejenigen ist, die ein 160H-Allel besitzen, verglichen mit denen, die kein 160H-Allel haben. Dies deutet darauf hin, dass ein rauchender Proband mit einem Genotyp, der voraussichtlich 50% der Fähigkeit zur Elimination von Nikotin über den CYP2A6-Weg verleiht, fast doppelt so wahrscheinlich mit dem Rauchen aufhört.