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Secuenciación metagenómica tipo shotgun de enriquecimientos bacterianos en la plataforma Oxford Nanopore utilizando el flujo R10 y el Kit de secuenciación por ligadura v2

CDChristopher Duda PRPadmini Ramachandran

Puntos clave

Se crearon con éxito bibliotecas de amplicones multiplexadas, mejorando la eficiencia y versatilidad de la secuenciación.
El uso de la química ONT V14 con el flujo R10 mejoró la calidad y precisión del proceso de secuenciación.
El protocolo optimiza la extracción de ADN de varios enriquecimientos bacterianos, permitiendo aplicaciones más amplias en la investigación microbiana.
Esta técnica abre vías para el estudio de comunidades bacterianas complejas en diferentes entornos.

Resumen

Este protocolo produce bibliotecas de amplicones multiplexadas a partir de ADN extraído de enriquecimientos bacterianos generales y selectivos utilizando el kit de secuenciación por ligadura de Nanopore, adecuado para la secuenciación en los sistemas MinION/Gridion de Oxford Nanopore Technologies (ONT) utilizando la química ONT V14 (SQK-NBD114-96).

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