La metilación del ADN en Arabidopsis tiene una base genética y muestra evidencia de adaptación local

La modulación del epigenoma proporciona potencialmente un mecanismo para que los organismos se adapten, dentro y entre generaciones. Sin embargo, ni la medida en que esto ocurre ni los mecanismos involucrados son conocidos. Aquí investigamos la variación de metilación del ADN en accesiones suecas de Arabidopsis thaliana cultivadas a dos temperaturas diferentes. Los efectos ambientales estaban limitados a los transposones, donde se encontró que la metilación CHH aumentaba con la temperatura. Los estudios de asociación del genoma completo (GWAS) revelaron que la extensa variación de metilación CHH estaba fuertemente asociada con variantes genéticas tanto en cis como en trans, incluyendo una asociación trans mayor cerca de la metiltransferasa de ADN CMT2. A diferencia de la metilación CHH, la metilación del cuerpo génico CpG (GBM) no se vio afectada por la temperatura de crecimiento, sino que en su lugar estaba correlacionada con la latitud de origen. Las accesiones de regiones más frías tenían niveles más altos de GBM para una fracción significativa del genoma, y esto estaba asociado con un aumento de la transcripción para los genes afectados. Los GWAS revelaron que este efecto se debía en gran medida a loci que actúan en trans, muchos de los cuales mostraron evidencia de adaptación local.