Sitios de reconocimiento de sustrato en proteínas de la familia de citocromo P450 2 (CYP2) inferidos a partir de análisis comparativos de secuencias de aminoácidos y nucleótidos codificantes.

Las regiones de reconocimiento de sustrato en las proteínas de la familia de citocromo P450 2 (CYP2) fueron inferidas mediante alineación grupal de las secuencias de CYP2 y las de P450 bacterianos, incluyendo Pseudomonas putida P450 101A (P450cam), cuyos residuos de unión al sustrato han sido definitivamente identificados por cristalografía de rayos X de una forma unida al sustrato (Poulos T. L., Finzel, B. C., y Howard, A. J. (1987) J. Mol. Biol. 195, 687-700). Los seis sitios de reconocimiento de sustrato putativos, SRSs, así identificados se localizan de manera dispersa a lo largo de la estructura primaria y constituyen aproximadamente el 16% de los residuos totales. Todas las mutaciones puntuales informadas y los fragmentos quiméricos que afectan significativamente las especificidades de sustrato de las enzimas CYP2 parentales cayeron dentro o se superpusieron a algunos de los seis SRSs. El análisis de patrones de sustitución de nucleótidos en miembros estrechamente relacionados en cuatro subfamilias, CYP2A, 2B, 2C y 2D, indicó consistentemente que los SRSs han acumulado más sustituciones no sinónimas (que cambian aminoácidos) que el resto de la secuencia. Esta observación apoya la idea de que la diversificación de los genes duplicados de P450 metabolizadores de fármacos ocurre principalmente en regiones de reconocimiento de sustrato para hacer frente a un número creciente de compuestos extranjeros.