Unión de un inhibidor péptido reducido a la proteína aspartica de Rhizopus chinensis: implicaciones para un mecanismo de acción.

Un inhibidor péptido, con la secuencia D-His-Pro-Phe-His-Phe psi CH2-NHPhe-Val-Tyr, con un enlace reducido entre los dos fenilalaninas adyacentes, se ha difundido en cristales de la proteína aspartica de Rhizopus chinensis (rhizopuspepsina, EC 3.4.23.6). Se han recopilado datos de difracción de rayos X a 1.8 Å de resolución sobre el complejo, que ha sido sometido a una refinación de mínimos cuadrados restringidos con un factor R (R igual a la suma del valor absoluto de la diferencia entre las amplitudes de los factores de estructura observados y calculados dividido por la suma de las amplitudes del factor de estructura observadas) de 14.7%. El inhibidor se encuentra dentro de la hendidura principal de la enzima y está claramente definido, con la excepción del D-histidina amino-terminal y la tirosina carboxilo-terminal. El enlace péptido reducido está ubicado en el sitio activo con contactos cercanos a los dos grupos aspartilo catalíticos. La molécula de agua en el sitio activo que se mantiene entre los dos grupos carboxilo es desplazada por el inhibidor, al igual que un número de otras moléculas de agua observadas en la hendidura de unión de la enzima nativa. Se propone un mecanismo de acción para esta clase de enzimas a partir de estos resultados.