El perfil transcriptómico de Arabidopsis indica que se activan múltiples vías regulatorias durante la aclimatación al frío además de la vía de respuesta al frío CBF.

Muchas plantas, incluidas Arabidopsis, aumentan su tolerancia a la congelación en respuesta a temperaturas bajas y no congelantes, un fenómeno conocido como aclimatación al frío. Estudios previos establecieron que la aclimatación al frío implica la rápida expresión de los activadores de transcripción CBF (también conocidos como proteínas DREB1) en respuesta a temperaturas bajas, seguido de la inducción del regulón CBF (genes objetivo de CBF), que contribuye a un aumento en la tolerancia a la congelación. Aquí presentamos los resultados de experimentos de perfil transcriptómico que indican la existencia de múltiples vías regulatorias de baja temperatura además de la vía de respuesta al frío CBF. Se determinaron los niveles de transcriptos de aproximadamente 8000 genes en múltiples momentos después de que las plantas fueron transferidas de temperaturas cálidas a frías y en plantas cultivadas en condiciones cálidas que expresaban de manera constitutiva CBF1, CBF2 o CBF3. Se identificaron un total de 306 genes como responsables del frío, con transcriptos para 218 genes aumentando y los de 88 genes disminuyendo tres veces o más en uno o más momentos durante el experimento de 7 días. Estos resultados indican que ocurre una extensa regulación a la baja de la expresión génica durante la aclimatación al frío. De los genes responsables del frío, 48 codifican factores de transcripción conocidos o putativos. Dos de estos, RAP2.1 y RAP2.6, fueron activados por la expresión de CBF y, por lo tanto, presumiblemente controlan subregulones del regulón CBF. Las comparaciones del transcriptoma indicaron que solo el 12% de los genes responsables del frío son ciertos miembros del regulón CBF. Además, al menos el 28% de los genes responsables del frío no fueron regulados por los factores de transcripción CBF, incluidos 15 que codifican factores de transcripción conocidos o putativos, indicando que estos genes responsables del frío son miembros de diferentes regulones de baja temperatura. Significativamente, la expresión de CBF a temperaturas cálidas reprimió la expresión de ocho genes que también fueron regulados a la baja por la temperatura baja, indicando que además de la inducción génica, la represión génica probablemente desempeña un papel integral en la aclimatación al frío.