Les essais de fibres d'ADN sont des outils puissants pour étudier la dynamique de réplique au niveau de la molécule unique. Cependant, leur application et leur adoption généralisée ont été entravées par la nature laborieuse et fastidieuse de l'analyse manuelle d'un grand nombre d'images. La quantification des fibres d'ADN marquées dépend généralement d'un examen, d'une sélection et d'une annotation subjectifs des fibres individuelles à partir d'images de microscopie à fluorescence, ce qui réduit la cohérence inter-utilisateurs, la reproductibilité et le débit expérimental. Pour résoudre ces problèmes, nous avons développé DNAi, un outil de vision par ordinateur basé sur l'apprentissage profond permettant la détection automatisée et la quantification de la longueur des fibres d'ADN marquées. DNAi a été entraîné sur un ensemble de données large et diversifié d'images annotées manuellement de fibres d'ADN et égalise la performance et la précision humaine en segmentation et mesure de longueur dans une large gamme de conditions expérimentales. L'outil open-source comprend une interface conviviale, permettant la validation visuelle et la sélection manuelle des fibres segmentées. Dans l'ensemble, DNAi permet une analyse robuste, rapide et reproductible des fibres d'ADN et est disponible gratuitement.
Playout et al. (Thu,) ont étudié cette question.