Analyse comparative des techniques de segmentation des noyaux pour une quantification améliorée de l'ADN dans des échantillons teintés au iodure de propidium

La numérisation dans les laboratoires de pathologie et de cytologie est désormais répandue, un changement significatif par rapport à une décennie passée où peu de médecins utilisaient des outils de traitement d'images. Bien que les temps de numérisation soient restés inchangés en raison de l'excitation dans l'imagerie fluorescente, les avancées en puissance de calcul et en logiciels ont permis d'utiliser des algorithmes plus complexes, produisant des résultats de meilleure qualité. Cette étude évalue trois algorithmes de segmentation des noyaux pour l'analyse de ploïdie en utilisant des lames WSI numériques teintées au iodure de propidium. Notre objectif était d'améliorer la précision de la segmentation pour mieux correspondre aux histogrammes d'ADN obtenus par cytométrie en flux, avec l'objectif ultime d'améliorer la méthode d'étalonnage que nous avons proposée dans une étude antérieure, qui vise à aligner les résultats de la cytométrie d'images avec ceux de la cytométrie en flux. Nous avons évalué ces algorithmes en fonction de la performance brute de segmentation et de la similarité des histogrammes d'ADN, en utilisant des métriques basées sur des matrices de confusion. Les résultats indiquent que les algorithmes modernes performent mieux, avec des scores F1 dépassant 0,845, comparé à 0,807 pour notre solution antérieure, et produisent des histogrammes d'ADN qui ressemblent davantage à ceux de la méthode de référence FCM.