Analyse in silico de l'effectorome sécrété du pathogène du caoutchouc Rigidoporus microporus mettant en évidence ses protéines de virulence potentielles

Rigidoporus microporus, l'agent causal de la maladie de pourriture blanche des racines des hévéas, représente une menace significative pour la production de caoutchouc naturel dans le monde entier. Comprendre les mécanismes moléculaires facilitant sa pathogénicité serait crucial pour développer des stratégies de gestion de la maladie efficaces. Le pathogène sécrète des protéines effectrices, qui jouent des rôles essentiels dans la modulation des réponses immunitaires de l'hôte et de l'infection. Dans cette étude, des analyses in silico ont identifié 357 protéines effectrices présumées sécrétées à partir du génome de R. microporus. Celles-ci ont ensuite été intégrées aux données précédentes de RNA-seq obtenues en réponse à l'exposition au latex d'hévéa. L'annotation des effecteurs présumés a suggéré l'abondance de protéines dans plusieurs familles associées à la virulence de R. microporus, en particulier les protéines hydrophobines et les protéines glycoside hydrolase (GH). La contribution des effecteurs sécrétés à la pathogénicité fongique a été discutée, notamment en réponse à l'exposition au latex d'hévéa. Certains effecteurs hautement exprimés inconnus ont été prédit pour les structures protéiques, révélant leur similarité avec l'aminopeptidase, la ligase d'ubiquitine, la sphéruline et la protéine thaumatine. Cette étude intégrative éclaire davantage le mécanisme moléculaire de la pathogénie de R. microporus et offre des cibles alternatives pour développer des stratégies de contrôle pour la gestion de la maladie de pourriture blanche dans les plantations d'hévéa.