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L'imagerie par résonance magnétique fonctionnelle chez les rongeurs a un grand potentiel pour faire progresser notre compréhension des réseaux cérébraux. Contrairement à la communauté humaine, il n'existe pas de ressource standardisée chez les rongeurs pour le traitement d'images, l'analyse et le contrôle de qualité, ce qui pose d'importantes limitations en termes de reproductibilité. Notre plateforme logicielle, Rodent Automated Bold Improvement of EPI Sequences, est un pipeline conçu pour répondre à ces limitations pour le prétraitement, le contrôle de qualité et la correction des confondants, en plus des meilleures pratiques pour la reproductibilité et la transparence. Nous démontrons la robustesse du flux de travail de prétraitement en validant les performances sur plusieurs sites d'acquisition et avec des données de souris et de rats. En nous basant sur une enquête approfondie des métriques de qualité des données à travers les sites d'acquisition, nous introduisons des lignes directrices pour le contrôle de la qualité de l'analyse de réseau et offrons des recommandations pour résoudre les problèmes. Pris ensemble, cette plateforme logicielle permettra à la communauté émergente d'adopter des pratiques reproductibles et de favoriser les progrès en neurosciences translationnelles.
Desrosiers-Grégoire et al. (Wed,) ont étudié cette question.