Diversité des ribosomes au niveau de la variation de l'ARNr associée à la santé et à la maladie humaines

Avec des centaines de copies d'ADNr, il est inconnu s'ils possèdent des variations de séquence qui forment différents types de ribosomes. Ici, nous avons développé un algorithme pour l'identification de variants à lecture longue, nommé RGA, qui a révélé que les variations dans les loci d'ADNr humains sont principalement des variants d'insertion-suppression (indel). Nous avons développé le séquençage d'ARNr de longueur complète (RIBO-RT) et le séquençage in situ (SWITCH-seq), qui ont montré que les ribosomes traduisants possèdent des variations dans l'ARNr. Plus de 1 000 variants sont peu exprimés. Cependant, des dizaines de variants sont abondants et forment des sous-types d'ARNr distincts avec des structures différentes près des indels, comme l'a révélé le sondage de la structure de l'ARNr à lecture longue couplé à un séquençage au sulfate de diméthyle. Les sous-types d'ARNr montrent une expression différentielle dans les tissus d'origine endodermique/ectodermique, et dans le cancer, les variants d'ARNr à faible abondance peuvent devenir hautement exprimés. Ensemble, cette étude identifie la diversité des ribosomes au niveau des variants d'ARNr, leur localisation chromosomique et leur structure unique ainsi que l'association de la variation des ribosomes avec la biologie spécifique des tissus et le cancer.