Une étude de découverte protéomique à grande échelle pour des marqueurs diagnostiques du cancer de la prostate utilisant ProteographTM et la spectrométrie de masse par mobilité ionique piégée.

Il existe un besoin non satisfait important pour des tests réflexes cliniques qui augmentent la spécificité des tests sanguins de l'antigène spécifique de la prostate, l'outil de diagnostic pour le cancer de la prostate ancien mais imparfait. Dans cette optique, nous présentons les résultats d'une étude de découverte qui identifie de nouveaux marqueurs réflexes de l'antigène spécifique de la prostate dans une cohorte de sérum de patients à grande échelle utilisant des technologies différenciantes pour une interrogation protéomique approfondie. Nous détectons des marqueurs sanguins connus du cancer de la prostate ainsi que de nouveaux candidats. Grâce à l'enrichissement bioinformatique des voies et à l'analyse de réseau, nous révélons des associations de protéines différemment abondantes avec des activités cytosquelettiques, métaboliques et ribosomiques, toutes précédemment associées à la progression du cancer de la prostate. De plus, l'analyse optimisée des classificateurs d'apprentissage machine révèle des signatures protéomiques capables de détecter la maladie avant la biopsie, ayant des performances comparables à un étalon de référence de calcul de risque clinique accepté.