L'analyse du réseau révèle des modules protéiques associés aux maladies respiratoires de l'enfance

Contexte L'année de vie est une période de développement immunitaire rapide qui peut influencer les trajectoires de santé et le risque de développer des maladies respiratoires, telles que l'asthme, les infections récidivantes et l'eczéma. Cependant, la biologie sous-jacente au développement ultérieur de la maladie reste inconnue. Méthodes En utilisant l'analyse de réseau de corrélation de gènes pondérés (WGCNA), nous avons dérivé des modules de protéines immunitaires hautement corrélées dans des échantillons de plasma d'enfants âgés de 1 an (N=294) issus de l'étude VDAART sur la réduction de l'asthme antenatal par la vitamine D. Nous avons appliqué des analyses de régression pour évaluer les relations entre les modules protéiques et le développement de maladies respiratoires infantiles jusqu'à l'âge de 6 ans. Nous avons ensuite caractérisé les facteurs génomiques, environnementaux et métabolomiques associés aux modules. Résultats La WGCNA a identifié quatre modules protéiques à l'âge de 1 an associés à l'incidence de l'asthme infantile et/ou des sifflements récurrents (plage P adj : 0,02-0,03), aux infections respiratoires (plage P adj : 6,3×10-9-2,9×10-6) et à l'eczéma (P adj =0,01) à l'âge de 6 ans ; trois modules étaient associés à au moins une exposition environnementale (plage P adj : 2,8×10-10-0,03) et des voies métabolomiques perturbées (plage P adj : 2,8×10-6-0,04). Aucun SNP à l'échelle du génome n'a été identifié comme facteur de risque génétique significatif pour aucun module protéique. Les relations entre les modules protéiques avec des facteurs cliniques, environnementaux et ‘omiques étaient sensibles au temps et ne pouvaient pas être recapturées dans les profils protéiques à l'âge de 6 ans. Conclusion Ces résultats suggèrent que les profils protéiques dès l'âge de 1 an prédisent le développement de maladies respiratoires jusqu'à l'âge de 6 ans et étaient associés à des changements dans les voies liées au métabolisme des acides aminés et de l'énergie. Ces résultats pourraient informer de nouvelles stratégies pour identifier des individus vulnérables sur la base du profilage des protéines immunitaires.