Atlas cellulaire temporel et spatial du niche alvéolaire régénérant dans la fibrose pulmonaire idiopathique

Résumé La réparation saine des alvéoles nécessite que les cellules souches alvéolaires se différencient en cellules conçues pour l'échange gazeux. Dans les maladies pulmonaires fibrosantes chroniques comme la fibrose pulmonaire idiopathique (FPI), les cellules épithéliales alvéolaires se régénèrent de manière anormale. La cause de cela est inconnue, mais son niche régénératif, fortement cellulaire, inflammé et structurellement altéré, est probablement pertinent. Ici, dans des ensembles uniques de tissus pulmonaires humains capturant la fibrose avancée, et avec une cytométrie de masse par imagerie à cellules uniques de 33-plex (IMC), nous fournissons un atlas cellulaire temporel et spatial à haute résolution et complet des niches alvéolaires régénérantes. En utilisant une suite d'outils mathématiques, nous exposons un réseau immunitaire organisé et identifions les macrophages alvéolaires CD206 hi comme cellule immunitaire centrale dans l'interactome épithélial-immune alvéolaire. Une analyse récepteur-ligand dirigée spatialement offre un mécanisme in-silico par lequel ces macrophages influencent la régénération alvéolaire. Notre étude dévoile un environnement cellulaire complexe et identifie des interactions clés qui influencent la régénération alvéolaire dans un poumon fibrotique.