Profilage moléculaire comparatif de l'adénocarcinome canalaire pancréatique de la tête versus corps et queue

Résumé L'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) de la tête (H) et du corps/de la queue (B/T) diffèrent par leur origine embryonnaire, leur composition cellulaire, leur apport sanguin, leur drainage lymphatique et veineux, ainsi que leur innervation. Nous visons à comparer les profils moléculaires et du microenvironnement immunitaire tumoral (TIME) du PDAC de H par rapport à B/T. Un total de 3499 échantillons de PDAC ont été analysés par séquençage de nouvelle génération (NGS) de l'ARN (transcriptome complet, NovaSeq), de l'ADN (NextSeq, 592 gènes ou NovaSeq, séquençage de l'exome complet) et d'immunohistochimie (Caris Life Sciences, Phoenix, AZ). La signification a été déterminée comme des valeurs de p ajustées pour corrections multiples (q) de 0.05. L'analyse d'expression des gènes liés à l'immuno-oncologie (IO) a montré une expression significativement plus élevée de CTLA4 et PDCD1 dans H (q < 0.05, changement de pli 1.2 et 1.3) et une tendance à une expression plus élevée d'IDO1 et PDCD1LG2 dans B/T (p < 0.05, changement de pli 0.95). À notre connaissance, c'est l'une des plus grandes cohortes de tumeurs PDAC soumises à un large profilage moléculaire. Les différences dans l'expression des gènes liés à l'IO et la distribution des cellules TIME suggèrent que la réponse aux thérapies IO peut différer dans le PDAC provenant de H par rapport à B/T. Des différences subtiles dans les profils génomiques des tumeurs H par rapport à B/T ont été observées.