Résumé 1054 : Axes d'expression réciproques circRNA-miRNA indicatifs d'une initiation tumorale précoce dans le sein

Résumé La prévention du cancer et la détection précoce sont les outils les plus efficaces pour le contrôle du cancer. Dans cette étude, nous adoptons une approche novatrice pour identifier un réseau d'axes protéine/mARN-circARN-miARN. Nous faisons l'hypothèse que la mutation des oncogènes ou des gènes suppresseurs de tumeurs durant la phase pré-oncogénique entraîne un changement aligné dans les niveaux des gènes dérivés des ARN circulaires, ainsi qu'inversement, dans les miARN spongés correspondants. Ces axes protéiques/risk prédictifs épigénétiques mARN-circARN-miARN servent d'outil potentiel pour la détection précoce des changements menant au cancer du sein (CS) et peuvent être utilisés comme biomarqueurs de dépistage non invasifs dans le sang des patients dans les populations susceptibles au cancer. Les patients atteints de CS dans le GDC Data Portal, projet TCGA-BRCA sont sélectionnés en fonction de plusieurs critères tels que leur âge au diagnostic (20-50 ans), le stade clinique précoce du cancer (stade I) et le type de maladie (néoplasmes canalaire et lobulaire). Les gènes différentiellement exprimés sont acquis à partir des données de séquençage mARN en comparant le cancer du sein de stade I à des tissus primaires normaux en utilisant R Studio. Ensuite, les mARN dont l'expression est alignée avec les circARN différentiellement exprimés et leurs gènes hôtes acquis de Gene Expression Omnibus (GEO) (GSE182471, tissus de cancer du sein triple négatif par rapport aux tissus normaux) sont sélectionnés. Les miARN différentiellement exprimés, en expression réciproque avec les circARN, sont définis à l'aide des données de séquençage des miARN des mêmes patients TCGA BRCA précédemment choisis. Les miARN sélectionnés sont supposés être spongés avec une haute confiance par les circARN sélectionnés sur la base d'un score de liaison en percentile contextuel dans CircInteractome. En utilisant KM Plotter, l'analyse de survie des miARN correspondants chez les patients atteints de CS de grade I est examinée. L'expression prédite des miARN a été corrélée avec des taux de survie plus bas chez les patients de stade I de CS dans KM Plotter. L'analyse d'enrichissement des miARN est utilisée pour valider davantage l'implication des miARN sélectionnés dans les événements tumoraux précoces en explorant dans quelles voies moléculaires leurs gènes en aval sont enrichis. Nous avons construit plus de 20 axes protéiques/risk potentiels mARN-circARN-miARN pour le dépistage non invasif des fluides corporels des patients (c'est-à-dire le sang) dans les populations susceptibles au CS en utilisant des données de séquençage d'ARN et de miARN disponibles dans des bases de données en ligne et valider davantage les axes proposés à l'aide d'outils in-silico. Les axes décrits, une fois validés dans des échantillons cliniques, pourraient fournir un outil potentiel pour la prédiction et la prévention du CS à un stade précoce. Format de citation : Nour Abbas Maatouk, Sarah Hussein Marei, Abdallah Bilal Kurdi, Nadim Shady Hamade, Rihab Raif Nasr, Rabih Shakib Talhouk. Axes d'expression circRNA-miRNA réciproques indicatifs d'une initiation tumorale précoce dans le sein résumé. Dans : Actes de la Réunion Annuelle de l'Association Américaine pour la Recherche sur le Cancer 2024 ; Partie 1 (Abstracts réguliers) ; 2024 Apr 5-10 ; San Diego, CA. Philadelphie (PA) : AACR ; Cancer Res 2024 ;84 (6Suppl) : Résumé nr 1054.