La crise des antibactériens : À la recherche de nouveaux antibiotiques et de mécanismes de résistance

Résumé Dans la lutte implacable pour la santé humaine, la prolifération de bactéries résistantes aux antibiotiques a émergé comme une catastrophe imminente d'une ampleur sans précédent, poussant potentiellement l'humanité au bord d'une crise sanitaire sans précédent. L'avancée inflexible de la résistance aux antibiotiques plane comme la principale menace du 21e siècle dans les domaines clinique, agricole et environnemental. On prévoit que la résistance aux antibiotiques sera à l'origine de la prochaine pandémie mondiale, avec des estimations sombres de dizaines de millions de vies perdues chaque année d'ici 2050. Au milieu de cette calamité imminente, notre capacité à dénicher de nouveaux antibiotiques a stagné, ces quarante dernières années étant gâchées par un décourageant « vide de découverte d'antibiotiques ». Avec près de 80 % de nos antibiotiques actuels provenant de sources naturelles ou semi-synthétiques, notre responsabilité est de lancer nos filets d'investigation dans des niches écologiques inexplorées grouillant de conflits microbiens, les soi-disant « oasis microbiennes d'interactions ». Au sein de ces oasis d'interactions, où les micro-organismes rivalisent intensément pour l'espace et les nutriments, une « course aux armements » microbienne dynamique et en constante évolution est toujours en place. Un tel cycle continu d'adaptation et de contre-adaptation est un aspect fondamental de l'écologie et de l'évolution microbiennes, ainsi que les secrets des antibiotiques uniques et inédits, notre dernier bastion contre la marée incessante de la résistance. Dans ce contexte, il est impératif d'investir dans la recherche pour explorer les royaumes compétitifs, tels que la rhizosphère des plantes, les crustacés biologiques du sol, les sources hydrothermales des profondeurs marines, la neige marine et la plastosphère moderne, dans lesquels les interactions compétitives sont à la base de la lutte des micro-organismes pour la survie et la domination dans leurs écosystèmes : identifier de nouveaux antibiotiques en ciblant les oasis microbiennes d'interactions pourrait représenter un « morceau manquant du puzzle » dans notre lutte contre la résistance aux antibiotiques.