Impact des méthodes d'inactivation bactérienne sur l'alimentation et la durée de vie en bonne santé de Caenorhabditis elegans

Des méthodes d'inactivation bactérienne précises sont essentielles pour les études nutritionnelles et de microbiote chez Caenorhabditis elegans, afin de déterminer si les effets observés proviennent des nutriments fournis par les bactéries ingérées ou d'interactions symbiotiques actives. Cependant, certaines méthodes d'inactivation altèrent la palatabilité bactérienne, compliquant les conclusions concernant leur impact direct. Nous avons cherché à identifier une méthode efficace pour inactiver la souche bactérienne Escherichia coli OP50, la source alimentaire standard pour la plupart des expériences sur C. elegans, qui préserve le comportement et la physiologie normaux de C. elegans. Nous avons comparé l'inactivation par chaleur (65 °C pendant 35 min) avec l'inactivation par paraformaldéhyde à 0,5 %. Les vers nourris avec des bactéries inactivées au PFA n'ont montré aucune aversion alimentaire et ont maintenu des niveaux de pompage pharyngé de type sauvage, des taux de fertilité et une accumulation de lipides, ressemblant étroitement au comportement et à la physiologie de vers nourris avec E. coli OP50 vivant. En revanche, les bactéries inactivées par chaleur ont provoqué une forte évitement alimentaire, une activité de pompage réduite, l'activation de la réponse aux protéines mal repliées mitochondriales (UPRmt), une diminution des réserves de lipides et de la fertilité, et une augmentation de la survie par rapport aux autres groupes. Ces résultats montrent que l'inactivation à 0,5 % de PFA préserve plus fidèlement les traits physiologiques et comportementaux de C. elegans que l'inactivation par chaleur, en faisant une méthode plus appropriée pour les études de microbiote et de nutrition.