Contexte. La propension de Streptococcus pyogenes (streptocoque du groupe A) à envahir des sites normalement stériles et à provoquer des maladies invasives à streptocoque du groupe A (iGAS) varie selon les souches, qui sont classées à l'aide du gène emm. Entre 2015 et 2017, une surveillance iGAS multis états a identifié une augmentation d'environ 150 fois d'un type emm particulier, l'emm 49. Cette analyse épidémiologique génomique visait à identifier les facteurs bactériens, patients et sociétaux associés à cette expansion. Méthodes. Nous avons analysé 1322 cas d'iGAS emm 49 et les séquences génomiques des isolats cliniques acquises grâce à la surveillance microbiologique active basée sur la population pendant 2015-2022. Pour chaque cas invasif, nous avons reçu à la fois un isolat cultivé et un formulaire de rapport de cas standardisé qui comprenait des attributs démographiques de base et des facteurs de risque d'infection. Une analyse phylogeographique a été réalisée pour reconstruire les temps de divergence et l'histoire de dispersion spatiale au sein de notre collection d'emm 49. Résultats. Comparés aux autres types emm, les cas d'emm 49 étaient plus fréquents chez les hommes (63,5 % contre 58,3 %, P =0,0143), chez les personnes sans abri (34,0 % contre 17,5 %, P <0,0001) et chez les personnes qui s'injectent des drogues (23,7 % contre 13,1 %, P <0,0001). L'analyse phylogeographique à échelle temporelle a estimé que l'ancêtre commun le plus récent des isolats d'expansion post-2015 est apparu vers 2004 et que l'emm 49 a émergé dans l'ouest des États-Unis. Conclusion. Nos résultats suggèrent que l'épidémie nationale actuelle pourrait provenir de l'introduction de l'emm 49 dans des sous-populations adultes défavorisées (sans abri et/ou utilisateurs de drogues injectables). Cette étude souligne comment la marginalisation sociale et les déterminants sociaux de la santé plus larges peuvent influencer l'épidémiologie des souches d'iGAS aux États-Unis.
Metcalf et al. (Thu,) studied this question.