Les lignées de souris transgéniques sont essentielles pour découvrir les relations génotype-phénotype au niveau des organes ou des systèmes. La génération de telles lignées via l'ajout de transgènes peut entraîner l'insertion dans des loci génomiques inconnus, conduisant potentiellement à la fois à la disruption de gènes natifs et à l'atténuation de l'expression du transgène. De plus, cela entraîne souvent l'incapacité de déterminer la zygosité du transgène, ce qui complique à son tour l'élevage et l'interprétation des résultats expérimentaux. Dans cette étude, nous présentons deux pipelines basés sur le séquençage de génome entier qui permettent l'identification et le génotypage même d'inserts multi-transgéniques complexes. Comme ils utilisent des réactifs et des outils bioinformatiques largement disponibles, ils peuvent facilement être appliqués pour développer des stratégies de génotypage dans potentiellement toutes les espèces.
Kaplan et al. (Thu,) ont étudié cette question.