Sur l'utilisation des antibiotiques pour contrôler les bactéries pathogènes des plantes : une perspective génétique et génomique

Malgré une attention croissante, les antibiotiques (tels que la streptomycine, l'oxytétracycline ou le kasugamycine) sont encore utilisés dans le monde entier pour le contrôle des principales maladies bactériennes des plantes. Cela soulève des inquiétudes quant à leur impact potentiel, encore inconnu, sur les résistances aux antibiotiques et multiresistantes et la propagation de leurs déterminants génétiques parmi les pathogènes bactériens. Les gènes de résistance aux antibiotiques (ARGs) ont été identifiés dans les bactéries pathogènes des plantes (PPB), les gènes de résistance à la streptomycine étant les plus souvent rapportés. Par conséquent, la contribution des éléments génétiques mobiles (MGEs) à leur propagation parmi les PPB, ainsi que leur capacité à se transférer à d'autres bactéries, doivent être davantage explorées. Le seul exemple bien documenté d'un vecteur d'ARGs dans les PPB, Tn5393 et ses variantes très similaires (portant des gènes de résistance à la streptomycine), est préoccupant en raison de sa présence en dehors des PPB, dans Salmonella enterica et Klebsiella pneumoniae, deux pathogènes humains majeurs. Bien que sa structure parmi les PPB soit encore relativement simple, dans les bactéries associées aux humains et aux animaux, Tn5393 a évolué en associations complexes avec d'autres MGEs et ARGs. Cette revue met en lumière les ARGs et MGEs associés aux PPB, mais aussi examine le rôle potentiel de l'utilisation des antibiotiques dans la sélection de la résistance chez les bactéries associées aux plantes.