Assemblage au niveau des chromosomes du génome du cheval tacheté (Hemibarbus maculatus Bleeker, 1871)

Le cheval tacheté (Hemibarbus maculatus Bleeker, 1871), un poisson benthique de taille petite à moyenne, est largement distribué entre les bassins des rivières Yangtze et Heilongjiang et est considéré comme l'un des poissons d'eau douce les plus largement distribués en Asie de l'Est. C'est également un poisson d'aquaculture économiquement précieux et est devenu une espèce d'aquaculture d'eau douce commerciale en Chine. Ici, un génome de cheval tacheté de haute qualité au niveau des chromosomes a été produit en combinant la technique de séquençage de molécules uniques PacBio et des technologies de capture de conformation chromosomique à haut débit. En fin de compte, le génome a été assemblé en 1098,66 Mb avec un N50 de contig de 33,57 Mb et un N50 de scaffold de 40,40 Mb. Nous avons construit un génome assemblé au niveau des chromosomes avec 25 chromosomes, dont les longueurs totales représentaient 97,49%, et le génome assemblé représente 95,64% de complétude (BUSCO). Nous avons également identifié 285,16 Mb (25,96%) de séquences génomiques répétées et 23233 gènes prédits. Un total de 23021 gènes ont été annotés fonctionnellement, représentant 99,09% des gènes prédits. Ces résultats fourniront des ressources génomiques précieuses pour l'étude ultérieure des caractéristiques génétiques, évolutives et biologiques du cheval tacheté.