La fidélité des ADN polymérases, définie comme leur capacité à incorporer un dNMP correct en face d'un nucléotide modèle non endommagé, est un facteur clé pour assurer la stabilité du génome. De nombreuses ADN polymérases ont été largement étudiées afin de comprendre la base structurelle et biochimique de leur fidélité. Cependant, la grande majorité de ces études ont utilisé des substrats simples de modèle d'amorce, négligeant les effets possibles de structures d'ADN plus complexes. Dans cette étude, nous avons estimé la fidélité d'une incorporation unique de dNMP par le fragment Klenow de l'ADN polymérase I d'Escherichia coli (KF) et l'ADN polymérase RB69 de bactériophage (RBpol) durant la synthèse de déplacement de brin, une situation courante dans la réplication des brins retardés et la réparation de l'ADN. Bien que KF était plus efficace que RBpol en présence d'un brin en aval, les deux polymérases ont montré une augmentation de la fidélité multipliée par 3 (jusqu'à un ordre de grandeur) par rapport au système d'amorce-modèle. Pour évaluer la dépendance de la fidélité à l'énergie dépensée pour la disruption de la paire de bases en amont, nous avons varié sa force en utilisant des incompatibilités et des analogues de bases synthétiques. Tant KF que RBpol ont généralement échangé efficacité pour fidélité, faisant moins d'erreurs lorsqu'ils devaient perturber des paires de bases plus fortes. Ainsi, la pénalité énergétique imposée par le brin en aval agit comme un point de contrôle de fidélité, améliorant la discrimination contre les nucléotides incorrects.
Yudkina et al. (Sun,) ont étudié cette question.