Le séquençage de l'exome identifie une mutation fréquente du gène du complexe SWI/SNF PBRM1 dans le carcinome rénal

La génétique du cancer du rein est dominée par l'inactivation du gène suppresseur de tumeur VHL dans le carcinome à cellules claires (ccRCC), le sous-type histologique le plus commun. Un dépistage récent à grande échelle d'environ 3 500 gènes par séquençage des exons basé sur la PCR a identifié plusieurs nouveaux gènes cancéreux dans le ccRCC, notamment UTX (également connu sous le nom de KDM6A), JARID1C (également connu sous le nom de KDM5C) et SETD2 (réf. 2). Ces gènes codent pour des enzymes qui déméthylenent (UTX, JARID1C) ou méthylent (SETD2) des résidus de lysine clés de l'histone H3. La modification de l'état de méthylation de ces résidus de lysine de l'histone H3 régule la structure de la chromatine et est impliquée dans le contrôle transcriptionnel. Cependant, ensemble, ces mutations sont présentes dans moins de 15 % des ccRCC, suggérant l'existence de gènes cancéreux supplémentaires, actuellement non identifiés. Ici, nous avons séquencé l'exome codant pour les protéines dans une série de ccRCC primaires et rapportons l'identification du gène du complexe de remodelage de la chromatine SWI/SNF PBRM1 (réf. 4) comme un deuxième grand gène cancéreux du ccRCC, avec des mutations truncatives dans 41 % (92/227) des cas. Ces données éclaircissent davantage l'architecture génétique somatique du ccRCC et soulignent la contribution marquée de la biologie chromatinienne aberrante.