Le diagnostic précis des sarcomes des tissus mous et des tumeurs osseuses présente des défis persistants en pratique pathologique. Bien que le séquençage de nouvelle génération (NGS) ciblé basé sur l'ARN ait amélioré la précision diagnostique grâce à la détection de gènes de fusion, son utilité clinique reste limitée pour le liposarcome dédifférencié (DDLPS) en raison de l'incapacité à identifier les variations du nombre de copies de MDM2 — une caractéristique diagnostique critique. Cette limitation est particulièrement pertinente cliniquement car les cas morphologiquement atypiques de DDLPS peuvent subir un test NGS ciblé sur l'ARN. Grâce à une analyse rétrospective de 150 patients soumis à un NGS ARN et une validation avec les données TCGA-SARC, nous avons développé un nouvel algorithme de dépistage du DDLPS utilisant les données NGS ARN, spécifiquement le nombre d'événements de fusion dans la région chromosomique 12q13–15 et les niveaux de transcript de MDM2. Ces deux mesures étaient significativement élevées dans le DDLPS comparé aux cas non-DLPS dans notre cohorte institutionnelle (p < 0,001). L'analyse ROC a établi des seuils diagnostiques optimaux : ≥3 fusions dans la région 12q13-15 ont obtenu une sensibilité de 100 % (IC à 95 % : 73,53 %-100 % ; 12/12) et une spécificité de 95,65 % (IC à 95 % : 90,78 %-98,39 % ; 132/138). De même, une expression ARN de MDM2 ≥ 100 TPM a montré une sensibilité de 100 % (IC à 95 % : 63,1 %-100 % ; 8/8) et une spécificité de 97,37 % (IC à 95 % : 90,8 %-99,7 % ; 74/76). L'algorithme a également bien fonctionné avec les données TCGA-SARC, bien qu'avec une coupure optimale légèrement différente, probablement en raison de différences dans les panneaux de gènes, la profondeur du séquençage, la couverture des gènes et les pipelines bioinformatiques. Cette étude présente une stratégie efficace pour le dépistage du DDLPS et potentiellement d'autres sarcomes amplifiés en MDM2.
Lei et al. (Mon,) ont étudié cette question.