Gènes de résistance aux antibiotiques provenant des déchets d'élevage : occurrence, dissémination et traitement

Résumé Les antibiotiques sont largement utilisés dans l'élevage, et divers types de gènes de résistance aux antibiotiques (ARGs) sont fréquemment détectés dans les déchets d'élevage à travers le monde. Les processus de traitement des déchets d'élevage conventionnels ne permettent pas de supprimer complètement les ARGs, ce qui entraîne leur libération dans les sols et les eaux. Diverses voies d'exposition de ces ARGs aux humains, y compris l'inhalation et l'ingestion de bactéries résistantes aux antibiotiques (ARB) qui les portent, pourraient contribuer à l'augmentation des infections cliniques résistantes qui sont de plus en plus difficiles à traiter avec des antibiotiques. Dans cette revue, nous évaluons l'occurrence et la variabilité des ARGs dans les déchets d'élevage et leurs voies potentielles de propagation vers les pathogènes humains. Nous passons également en revue les mécanismes et les facteurs environnementaux qui influencent la dissémination des ARGs à travers ces voies, et évaluons l'efficacité d'élimination des ARGs des approches courantes de gestion des déchets d'élevage. Les défis et les besoins de recherche pour évaluer et atténuer le risque de dissémination de la résistance aux antibiotiques provenant des déchets d'élevage sont également présentés.