UniProt : la base de connaissances universelle sur les protéines

Pour fournir à la communauté scientifique une ressource unique, centralisée et autoritaire pour les séquences de protéines et les informations fonctionnelles, les activités des bases de données de protéines Swiss-Prot, TrEMBL et PIR se sont unies pour former le consortium Universal Protein Knowledgebase (UniProt). Notre mission est de fournir une base de connaissances sur les séquences de protéines complète, entièrement classée, riche et précisément annotée, avec de nombreuses références croisées et interfaces de requête. La base de données centrale comportera deux sections, correspondant aux entrées familières de Swiss-Prot (entrées entièrement curées manuellement) et TrEMBL (enrichie par une classification automatique, des annotations et de nombreuses références croisées). Pour des recherches de séquences pratiques, UniProt fournit également plusieurs bases de données de séquences non redondantes. Les bases de données UniProt NREF (UniRef) offrent des sous-ensembles représentatifs de la base de connaissances adaptés pour des recherches efficaces. L'archive UniProt complète (UniParc) est mise à jour quotidiennement à partir de nombreuses bases de données publiques. Les bases de données UniProt peuvent être consultées en ligne (http://www.uniprot.org) ou téléchargées dans plusieurs formats (ftp://ftp.uniprot.org/pub). La communauté scientifique est encouragée à soumettre des données pour inclusion dans UniProt.