Un i-motif minimal stabilisé par des tétrades G:T:G:T dans le sillon mineur

Les séquences d'ADN répétitives trouvées aux télomères et aux centromères jouent un rôle crucial dans la structure et la fonction des chromosomes eucaryotes. Ce rôle peut être lié à la tendance observée dans de nombreux ADNs répétitifs à adopter des structures non canonique. Bien qu'il y ait une reconnaissance croissante de l'importance des quadruplexes d'ADN dans la biologie des chromosomes, la co-existence de différents éléments formant des quadruplexes dans la même structure d'ADN reste un sujet de débat. Ici, nous rapportons l'étude structurelle de l'oligonucléotide d(TCGTTTCGT) et de son analogue cyclique d. Les deux séquences forment des structures de quadruplexe dimériques consistant en un i-motif minimal coiffé, à chaque extrémité, par une tétrade G:T:G:T alignée dans le sillon mineur. Ces mini i-motifs, qui ne présentent pas les spectres CD caractéristiques d'autres structures d'i-motif, peuvent être observés à pH neutre, bien qu'ils soient plus stables dans des conditions acides. Cette découverte est particulièrement pertinente puisque ces séquences d'oligonucléotide ne contiennent pas de cytosines contiguës. Il est important de noter que ces structures ressemblent à la moité de boucle adoptée par un fragment de 11 nucléotides du motif de la protéine centromérique conservée B (CENP-B), qui est le site de liaison pour le CENP-B.