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La technologie des microarrays est devenue une partie intégrante de la recherche biomédicale et de plus en plus de jeux de données deviennent disponibles via des dépôts publics. Cependant, la réutilisation de ces ensembles de données est sévèrement freinée par des informations sur les échantillons biologiques non structurées, manquantes ou incorrectes, ainsi que par la grande variété de méthodes de prétraitement en usage. Le package inSilicoDb R/Bioconductor est une interface en ligne de commande vers la base de données InSilico DB, une base de données en ligne contenant actuellement 86 104 profils d'expression humains Affymetrix experts-curés compilés à partir de 1937 séries du dépôt GEO. L'utilisation de ce package repose sur l'accent mis par le projet Bioconductor sur la reproductibilité en permettant un flux de travail clair dans lequel non seulement l'analyse, mais aussi la récupération de données vérifiées est facilitée.
Taminau et al. (Mer,) ont étudié cette question.
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