Gene3D : Prévision extensive des domaines globulaires dans les protéines

Gene3D (http://gene3d.biochem.ucl.ac.uk) est une base de données d'annotations de domaines globulaires pour des millions de séquences protéiques disponibles. Gene3D a déjà été présenté dans le numéro des bases de données de NAR et ici nous rapportons une mise à jour significative de la base de données Gene3D. La version actuelle, Gene3D v16, a considérablement élargi sa couverture de domaines par rapport à la version précédente et contient désormais plus de 95 millions d'attributions de domaines. Nous rapportons également une nouvelle méthode pour traiter des architectures de domaines complexes existant dans Gene3D, résultant de domaines discontinus. Parmi d'autres mises à jour, nous avons ajouté des outils de visualisation pour explorer les annotations de domaines dans le contexte d'autres caractéristiques de séquence et dans les familles de gènes. Nous fournissons également des pages web pour visualiser d'autres familles de domaines qui coexistent avec une famille de domaine de requête donnée.