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De grands contrastes sont observés entre les populations d'ARN messager de différents tissus et des embryons à différents stades de développement. Néanmoins, les séquences codantes pour des gènes non exprimés dans une cellule semblent présentes dans son ARN nucléaire. Bien que de nombreux transcrits d'ARN nucléaires de séquences d'ADN à copie unique soient communs entre les tissus, un ensemble supplémentaire, probablement constitué de séquences non messagères, n'est pas partagé. L'ARN nucléaire contient également des transcrits de séquences d'ADN répétitives. Certaines familles de répétitions sont représentées à des niveaux élevés dans l'ARN nucléaire de tissus particuliers et à des niveaux beaucoup plus bas dans d'autres. Il est surprenant que les deux compléments de la plupart des séquences de répétition soient présents dans l'ARN nucléaire. Ces observations conduisent à un modèle de régulation de l'expression génique dans lequel la formation de duplexes d'ARN répétitifs contrôle la production d'ARN messager.
Davidson et al. (Ven,) ont étudié cette question.