Virioplancton : Virus dans les écosystèmes aquatiques

La découverte que les virus pourraient être les organismes les plus abondants dans les eaux naturelles, surpassant le nombre de bactéries d'un ordre de grandeur, a inspiré un regain d'intérêt pour les virus dans l'environnement aquatique. Étonnamment peu de choses étaient connues sur l'interaction des virus et de leurs hôtes dans la nature. Au cours de la dernière décennie, depuis la publication des rapports sur des populations de virus extraordinairement grandes, l'énumération des virus dans les environnements aquatiques a démontré que le virioplancton constitue des composants dynamiques du plancton, changeant de manière dramatique en nombre selon la localisation géographique et la saison. Les preuves à ce jour suggèrent que les communautés de virioplancton sont composées principalement de bactériophages et, dans une moindre mesure, de virus algaux eucaryotes. L'influence de l'infection virale et de la lyse sur les communautés hôtes de bactéries et de phytoplancton a été mesurable après le développement de nouvelles méthodes et l'incorporation de connaissances antérieures sur la biologie des bactériophages dans les concepts d'interactions entre parasites et hôtes. Les nouvelles méthodes ont fourni des données montrant que l'infection virale peut avoir un impact significatif sur les populations de bactéries et d'algues unicellulaires, soutenant l'hypothèse selon laquelle les virus jouent un rôle significatif dans les réseaux alimentaires microbiaux. En plus de la prédation limitant les populations de bactéries et de phytoplancton, la nature spécifique de l'interaction virus-hôte soulève la possibilité intrigante que l'infection virale influence la structure et la diversité des communautés microbiennes aquatiques. Des applications novatrices des techniques de génétique moléculaire ont fourni de bonnes preuves que l'infection virale peut influencer significativement la composition et la diversité des communautés microbiennes aquatiques.