La dynamique du microbiote racinaire d'Arabis alpina pérenne dépend du temps de résidence dans le sol mais est indépendante du temps de floraison

Des expériences récentes sur le terrain et en laboratoire avec la Boechera stricta pérenne et l'Arabidopsis thaliana annuelle suggèrent que le microbiote racinaire influence le temps de floraison. Ici, nous avons examiné, dans des expériences de suivi à long terme, le microbiote bactérien racinaire de l'Arabis alpina pérenne arctique-alpin dans des environnements naturels et contrôlés par le profilage du gène 16S rRNA. Nous avons identifié le type de sol et le temps de résidence des plantes dans le sol comme des déterminants majeurs expliquant jusqu'à 15 % de la variation du microbiote racinaire, tandis que les conditions environnementales et le génotype hôte expliquent au maximum 11 % de la variation. Lorsqu'elles sont cultivées dans le même sol, la composition du microbiote racinaire de l'A. alpina pérenne est largement similaire à celle de ses parents annuels, A. thaliana et Cardamine hirsuta. Les plantes A. alpina de type sauvage non florifères et les plantes mutantes pep1 florifères assemblent un microbiote racinaire essentiellement indistinguable, déconnectant ainsi le temps de floraison des changements du microbiote dépendants du temps de résidence des plantes. Cela révèle la robustesse du microbiote racinaire contre le début et la floraison perpétuelle de l'A. alpina. Ensemble avec des études précédentes, cela implique un modèle dans lequel certaines parties du microbiote racinaire modulent le temps de floraison, tandis qu'après l'acquisition du microbiote pendant la croissance végétative, l'assemblage bactérien racinaire établi est structurellement robuste aux perturbations causées par la floraison et les changements drastiques de la stature des plantes.