Variation des communautés microbiennes gastro-intestinales de Drosophila melanogaster en fonction des étapes de la vie

Drosophila melanogaster a été un modèle biologique utile depuis sa première utilisation, il y a plus de 100 ans. Principalement en raison de sa similarité génétique avec les humains, ce qui a permis de représenter avec précision le fonctionnement de divers systèmes biologiques, tels que la fonction immunitaire, les voies liées aux maladies, l'hérédité des gènes, le développement des œufs et, dans ce cas, l'écosystème microbien. Les changements liés à l'âge dans le microbiote intestinal de D. melanogaster offrent de précieux aperçus sur la relation dynamique entre un hôte et ses micro-organismes tout au long de sa vie et peuvent être extrapolés à d'autres organismes. Cette étude se concentre sur les changements potentiels que le microbiote subit à travers les différentes étapes du cycle de vie de la mouche, générant des données robustes et haute résolution en utilisant le séquençage MinION à nanopores comme approche de pointe pour l'analyse du microbiote. Nos résultats soulignent la nature hautement dynamique du microbiote intestinal tout au long de la vie de D. melanogaster et soulignent la nécessité de tenir compte explicitement de l'étape de développement et de l'âge chronologique dans les études axées sur le microbiote. De plus, une compréhension plus claire de ces changements microbiaux temporels fournit des informations précieuses sur la façon dont les interactions hôte-microbiote sont façonnées au cours du développement, maintenues à l'âge adulte et finalement modifiées pendant le vieillissement. Actuellement, le microbiote intestinal s'est stabilisé après l'établissement post-éclosion, tandis que la dysbiose liée à l'âge et le déclin immunitaire ne se sont pas encore manifestés. Par conséquent, l'utilisation de mouches d'environ 1 semaine maximise la cohérence expérimentale et la sensibilité, ce qui en fait un modèle optimal pour enquêter sur les interventions ciblées sur le microbiote.