Utilité du séquençage de l'exome entier pour ceux qui sont proches de la fin de l'odyssée diagnostique : il est temps de combler les lacunes dans les soins

Un diagnostic précis est un élément integral des soins aux patients pour les enfants atteints de maladies génétiques rares. Les récentes avancées dans le séquençage, en particulier le séquençage de l'exome entier (WES), identifient la base génétique de la maladie pour 25 à 40 % des patients. Le taux de diagnostic est probablement influencé par le moment où le WES est utilisé dans le processus diagnostique. Le projet Finding Of Rare Disease GEnes (FORGE) Canada était un effort national pour identifier les mutations des troubles d'apparition infantile en utilisant le WES. La plupart des enfants inscrits au projet FORGE étaient vers la fin de l'odyssée diagnostique. Les deux résultats principaux de FORGE étaient la découverte de nouveaux gènes et l'identification des mutations dans des gènes connus pour causer des maladies. Dans ce dernier cas, le WES a identifié des mutations dans des gènes de maladies connues pour 105 des 362 familles étudiées (29 %), informant ainsi l'impact du WES dans le cadre de l'odyssée diagnostique. Notre analyse de cet ensemble de données a montré que ces gènes de maladies connus n'étaient pas identifiés avant l'inscription au WES pour deux raisons clés : l'hétérogénéité génétique associée à un diagnostic clinique et la présentation atypique de maladies connues et cliniquement reconnues. Ce qui devient de plus en plus clair, c'est que le WES va modifier le paradigme pour les patients et les familles avec des maladies génétiques rares.