Avancées récentes dans le docking moléculaire pour la recherche et la découverte de médicaments marins potentiels

Les médicaments marins sont utilisés depuis longtemps et présentent des avantages uniques dans les pratiques cliniques. Parmi les médicaments marins qui ont été approuvés par la Food and Drug Administration (FDA), les interactions protéine-ligand, telles que cytarabine-ADN polymérase, vidarabine-adenylyl cyclase et complexes eribuline-tubuline, représentent les mécanismes d'action importants pour leur efficacité. Cependant, les composants complexes et multi-ciblés des ressources médicinales marines, leur base chimique bio-active et leurs mécanismes d'action ont posé d'énormes défis dans la découverte et le développement des médicaments marins jusqu'à présent, lesquels doivent être systématiquement étudiés en profondeur. Le docking moléculaire pourrait prédire efficacement le mode de liaison et l'énergie de liaison des complexes protéine-ligand et est devenu une méthode majeure de conception de médicaments assistée par ordinateur (CADD), ce qui fait que cet outil puissant a été largement utilisé dans de nombreux aspects de la recherche sur les médicaments marins. Cette revue présente les principes de base et les logiciels du docking moléculaire et résume également les applications de cette méthode dans la découverte et la conception de médicaments marins, y compris le dépistage virtuel précoce dans la phase de découverte de médicaments, la découverte de cibles médicamenteuses, les mécanismes d'action potentiels et la prédiction du métabolisme des médicaments. De plus, cette revue discutera également et envisagera les problèmes du docking moléculaire, afin de fournir une base théorique plus solide pour les pratiques cliniques et la recherche et le développement de nouveaux médicaments marins.