Corrélation entre la stabilité d'une protéine et sa composition en dipeptides : une nouvelle approche pour prédire la stabilité in vivo d'une protéine à partir de sa séquence primaire

L'analyse statistique de 12 protéines instables et 32 protéines stables a révélé qu'il existe certains dipeptides dont l'occurrence est significativement différente dans les protéines instables par rapport à celles stables. En fonction de l'impact de ces dipeptides sur les protéines instables par rapport aux stables, une valeur de poids d'instabilité est attribuée à chacun des dipeptides. Pour une protéine donnée, la somme de ces valeurs de poids normalisées à la longueur de sa séquence aide à distinguer entre protéines instables et stables. Les résultats suggèrent que l'instabilité in vivo des protéines est probablement déterminée par l'ordre de certains acides aminés dans sa séquence. Une tentative est faite pour corréler la stabilité métabolique des protéines avec les caractéristiques de leur séquence primaire où les valeurs de poids d'instabilité pour une protéine de séquence connue pourraient ainsi être utilisées comme un indice pour prédire ses caractéristiques de stabilité.