Profilage d'expression à l'échelle du génome révèle l'inhibition associée au VEB de l'expression des molécules du CMH de classe I dans le carcinome nasopharyngé

Pour identifier les mécanismes moléculaires par lesquels les cancers épithéliaux associés au VEB sont maintenus, nous avons mesuré l'expression de pratiquement tous les gènes humains et de tous les gènes latents du VEB dans une collection de 31 échantillons de tissus de carcinome nasopharyngé (CNP) capturés au laser et microdissectés ainsi que dans 10 tissus nasopharyngés normaux. Les profils d'expression génétique globaux ont clairement distingué les tumeurs de l'épithélium sain normal. Les niveaux d'expression de six gènes viraux (EBNA1, EBNA2, EBNA3A, EBNA3B, LMP1 et LMP2A) étaient corrélés entre eux et fortement corrélés inversement avec l'expression d'un large sous-ensemble de gènes de l'hôte. Parmi les gènes humains dont l'inhibition était fortement corrélée à une augmentation de l'expression des gènes du VEB figuraient plusieurs gènes HLA de classe I du CMH impliqués dans la régulation de la réponse immunitaire via la présentation des antigènes. L'association entre l'expression des gènes du VEB et l'inhibition de l'expression des molécules du CMH de classe I HLA implique que l'affichage des antigènes est soit directement inhibé par le VEB, facilitant l'évasion immunitaire par les cellules tumorales, et/ou que les cellules tumorales avec une présentation inhibée sont sélectionnées pour leur capacité à soutenir des niveaux plus élevés de VEB afin de tirer le maximum parti des actions oncogènes médiées par le VEB favorisant la tumeur. Nos données reflètent clairement cette promotion tumorale, montrant que la dérégulation de protéines clés impliquées dans l'apoptose (protéine A1 apparentée à BCL2 et molécule inhibitrice apoptotique Fas), les points de contrôle du cycle cellulaire (AKIP, SCYL1 et NIN), et la métastase (métalloprotéinase matricielle 1) est étroitement corrélée aux niveaux d'expression des gènes du VEB dans le CNP.