Les orientations différentielles du domaine de liaison à l'ADN et de l'interface de dimérisation carboxy-terminale régulent la sélection des sites de liaison par les hétérodimères de récepteurs nucléaires.

Les récepteurs de l'acide rétinoïque, des hormones thyroïdiennes et de la vitamine D activent préférentiellement les gènes cibles à travers des éléments de réponse constitués d'agencements de répétitions directes d'un motif de reconnaissance central ayant la séquence consensus AGGTCA. Nous présentons des preuves que la préférence pour les éléments à répétition directe découle de deux différences fondamentales par rapport aux récepteurs d'hormones stéroïdiennes. Premièrement, il a été démontré que les récepteurs de l'acide rétinoïque, des hormones thyroïdiennes et de la vitamine D forment préférentiellement des hétérodimères avec les récepteurs X des rétinoïdes. Ces interactions sont médiées par l'interface de dimérisation carboxy-terminale, avec une préférence pour l'hétérodimère spécifiée par les actions du domaine de liaison à l'ADN. Deuxièmement, les domaines de liaison à l'ADN des récepteurs hétérodimériques semblent être flexibles rotationnellement par rapport à l'interface de dimérisation carboxy-terminale. Plusieurs lignes de preuves indépendantes suggèrent que, par rapport aux récepteurs X des rétinoïdes et aux récepteurs d'hormones stéroïdiennes, le domaine de liaison à l'ADN du récepteur des hormones thyroïdiennes est préféré de tourner d'environ 180 degrés par rapport à son interface de dimérisation carboxy-terminale. En conséquence, les interactions en solution entre les interfaces de dimérisation carboxy-terminales des récepteurs X des rétinoïdes et des hormones thyroïdiennes devraient conduire à l'alignement préférentiel de leurs domaines de liaison à l'ADN respectifs dans une configuration de répétition directe. Cet alignement positionnerait le récepteur X des rétinoïdes au-dessus du motif de reconnaissance en amont des éléments de réponse à répétition directe. Les orientations différentielles du domaine de liaison à l'ADN, qui contribuent à la polarité de la liaison des hétérodimères, sont régulées par une courte séquence (la boîte A) située entre les domaines de liaison à l'ADN conservés et de dimérisation carboxy-terminale.