La microbiologie de l'infection du sang : tendances sur 20 ans du programme de surveillance antimicrobienne SENTRY

Les organismes responsables d'infections du sang (BSI) ont été collectés consécutivement dans plus de 200 centres médicaux dans 45 pays entre 1997 et 2016. L'identification des espèces et les tests de sensibilité ont suivi les méthodes de microdilution en bouillon de l'Institute of Clinical and Laboratory Standards à un laboratoire central. Des données cliniques et des isolats de 264 901 épisodes de BSI ont été collectés. Le pathogène le plus courant était Staphylococcus aureus (20,7 %), suivi par Escherichia coli (20,5 %), Klebsiella pneumoniae (7,7 %), Pseudomonas aeruginosa (5,3 %) et Enterococcus faecalis (5,2 %). S. aureus était le pathogène le plus fréquemment isolé dans l'ensemble durant la période 1997-2004, mais E. coli était le plus commun après 2005. La fréquence des pathogènes variait selon la région géographique, le statut d'apparition à l'hôpital ou en milieu communautaire, et l'âge des patients. La prévalence des isolats de S. aureus résistants à l'oxacilline (ORSA) a augmenté jusqu'en 2005 à 2008 puis a diminué parmi les BSI d'apparition hospitalière et communautaire dans toutes les régions. La prévalence des entérocoques résistants à la vancomycine (VRE) est restée stable après 2012 (16,4 % au total). La résistance à la daptomycine parmi S. aureus et les entérocoques (DRE) est restée rare (les Entérobactéries ont augmenté de 6,2 % en 1997 à 2000 à 15,8 % en 2013 à 2016). Les taux de MDR étaient les plus élevés parmi les bacilles Gram-négatifs non fermentaires (GNB), et la colistine était le seul agent avec une activité prévisible contre le complexe Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus (97 % sensibles). En conclusion, S. aureus et E. coli étaient les causes predominantes de BSI dans le monde durant cette période de surveillance de 20 ans. Les phénotypes résistants importants parmi les pathogènes Gram-positifs (MRSA, VRE ou DRE) étaient stables ou en déclin, tandis que la prévalence des MDR-GNB a augmenté continuellement durant la période surveillée. Les MDR-GNB représentent le plus grand défi thérapeutique parmi les pathogènes bactériens courants des BSI.