Vers un archivage de données robuste et pratique basé sur l'ADN utilisant le système de codec yin-yang

L'ADN est un support de stockage de données prometteur en raison de sa durabilité remarquable et de son stockage économiseur d'espace. Les premiers schémas de transcoding bit-à-base ont principalement poursuivi la densité d'information, au détriment de l'introduction de défis de biocompatibilité ou d'échec de décodage. Ici, nous proposons un algorithme de transcoding robuste nommé codec yin-yang, utilisant deux règles pour encoder deux bits binaires en un nucléotide, afin de générer des séquences d'ADN hautement compatibles avec les technologies de synthèse et de séquençage. Nous avons encodé deux formats de fichier représentatifs et les avons stockés in vitro sous forme de pools d'oligos de 200 nt et in vivo en tant que fragment d'ADN d'environ 54 kbps dans des cellules de levure. Les résultats de séquençage montrent que le codec yin-yang présente une grande robustesse et fiabilité pour une grande variété de types de données, avec un taux de récupération moyen de 99,9 % au-dessus de 10^4 copies moléculaires et un taux de récupération atteint de 87,53 % à ≤10^2 copies. De plus, la démonstration de stockage in vivo a atteint une densité physique mesurée expérimentalement proche du maximum théorique.