Progrès et utilité du protéome plasmatique humain

L'étude des protéines circulant dans le sang offre d'énormes opportunités pour diagnostiquer, stratifier ou éventuellement prévenir des maladies. Avec les avancées technologiques récentes et le besoin urgent de comprendre les effets de la COVID-19, l'analyse protéomique du sérum et du plasma d'origine sanguine est devenue encore plus importante pour étudier la biologie humaine et la pathophysiologie. Ici, nous fournissons des points de vue et des perspectives sur les développements technologiques et les applications cliniques possibles utilisant des méthodes basées sur la spectrométrie de masse (MS) ou l'affinité. Nous discutons d'exemples où la protéomique plasmatique a contribué à des aperçus précieux sur les infections par le SARS-CoV-2, le vieillissement et l'hémostase, ainsi que des opportunités offertes par la combinaison de la protéomique avec des données génétiques. En tant que contribution au Human Proteome Organization (HUPO) Human Plasma Proteome Project (HPPP), nous présentons le Human Plasma PeptideAtlas build 2021-07 qui comprend 4395 protéines humaines canoniques et 1482 protéines humaines non redondantes supplémentaires détectées dans 240 expériences basées sur la MS. De plus, nous rapportons le nouveau Human Extracellular Vesicle PeptideAtlas 2021-06, qui comprend cinq études et 2757 protéines canoniques détectées dans des vésicules extracellulaires circulant dans le sang, dont 74 % (2047) sont en commun avec le PeptideAtlas plasmatique. Notre aperçu résume les avancées récentes, les applications d'impact et les défis en cours pour traduire la protéomique plasmatique en utilité pour la médecine de précision.