Le séquençage des ARN nucléaires de neurones uniques révèle des signatures moléculaires d'activation

Les méthodes de séquençage unicellulaire ont émergé comme des outils puissants pour l'identification de types cellulaires hétérogènes au sein de régions cérébrales définies. L'application de techniques unicellulaires pour étudier le transcriptome des neurones activés peut offrir un aperçu des dynamiques moléculaires associées aux réponses neuronales différentielles à une expérience donnée. Grâce à l'évaluation des méthodes courantes de séquençage RNA de cellules entières et de noyaux uniques (snRNA-seq), nous montrons ici que le snRNA-seq reproduit fidèlement les schémas transcriptionnels associés à l'induction d'activité induite par l'expérience, y compris des gènes immédiats d'activation (IEGs) tels que Fos, Arc et Egr1. Le snRNA-seq des cellules granuleuses dentaires de souris révèle des changements à grande échelle dans le transcriptome neuronal activé après une brève exposition à un nouvel environnement, y compris l'induction de gènes de la voie MAPK. De plus, nous observons un continuum d'états d'activation, révélant un modèle pseudotemporel d'activation uniquement à partir de l'expression génique. En résumé, le snRNA-seq des neurones activés permet d'examiner l'expression génique au-delà des IEGs, offrant ainsi de nouvelles perspectives sur les schémas d'activation neuronale in vivo.