KaKsCalculator 3.0 : Calcul de la Pression Sélective sur les Séquences Codantes et Non Codantes

Résumé KaKsCalculator 3.0 est un outil mis à jour capable de calculer la pression sélective sur les séquences codantes et non codantes. Semblable au rapport du taux de substitution non synonyme/synonyme pour les séquences codantes, la sélection sur les séquences non codantes peut être quantifiée comme le rapport du taux de substitution de nucléotides non codants au taux de substitution synonyme des séquences codantes adjacentes. Comme le montrent les données empiriques, KaKsCalculator 3.0 montre son efficacité à détecter la force et le mode de sélection opérant sur des séquences moléculaires, démontrant ainsi son grand potentiel pour réaliser un scan à l'échelle du génome de la sélection naturelle sur diverses séquences et l'identification d'éléments fonctionnels potentiellement à l'échelle du génome entier. Le package de KaKsCalculator 3.0 est librement disponible pour un usage académique uniquement sur https://ngdc.cncb.ac.cn/biocode/tools/BT000001.